邱有岩(生卒年不详)，字孔观，号兖泉。家晋江祥芝(今属石狮市祥芝镇)。明代嘉靖至万历时人。其父邱寿民深研经术，是一个远近知名的塾师。有岩幼承家教，17岁时已文才出众。泉州太守俞咨伯考校士子，对他的文章大加赞叹，称之为“天下名士”，把他列为第一名，每每在泉州缙绅之间赞誉之。俞咨伯知道有岩家贫尚未成家后，替他作媒，聘娶了侍郎顾珀的外孙女李氏，使有岩更有名气。嘉靖二十五年(1546年)，有岩考中举人，7年后，进士及第，其时才三十出头。有岩初任南京吏部主事(正六品)，政事之余，总是手不释卷，如饥似渴地读书。有人不理解，他说：“我一边从政一边读书，正是为了学以致用，办好政事。”有岩考进士时，主考官是徐阶。徐阶执政时，邱有岩在他属下当了几年官，不仅没有借着座师门生这层关系去营钻，而且连一封拜谒的书信也没有写，徐阶反因此器重他。当他准备调任地方官时，徐阶把他留下，作为吏部考功郎(正五品)，负责甄别人才、考核官员。有岩果然能破除私人情面，杜绝舞弊营钻的门径，认真负起职责。有一次在处理一批不合格的官员时，吏部尚书有意庇护其中某个官员，有岩不同意，尚书声色皆厉，摆出上司的架子压人，有岩毅然抗争：“如果这个官员不撤职，那就先撤掉我的官职!”最后，上司只得作罢。徐阶知道这件事后，深为嘉叹，写信向他征询用人之道。有岩为他举荐姜凤阿等20多人，这些人当时职位都很低，但后来多成为一代名臣。
徐阶在位时，先前追随奸相严嵩的一些人便来依附他，表面上望风承旨，暗地里互相枘凿，徐阶不曾觉察。有岩历举各朝事例对他反复开譬，说明邪正不可调和，得到徐价的采纳。后来徐阶罢相，那批人果然一一现出两面派的真面目。接任的宰相高拱喜欢任用亲近他的人办事，有岩在他手下多年才调任应天(南京)府丞，代理知府。有岩在任时，“修废雪冤，抑强扶士，暮金不入，条格一新”，替百姓办了不少好事，却因为不会巴结上司，进见高拱时“仅持二币”，不久，竟遭某御史弹劾，解职回乡。
有岩为人严毅，寡言笑，从来容不得他人通过他舞弊营私。个人生活相当俭朴，平生布衣蔬食，不娶姬妾，不娱鼓乐，不蓄玩好，只喜欢藏书。罢官后他把购置的书籍运回家乡，盖起了一座叫“木末亭”的书斋，每日吟啸其中，杜门谢客，课督子孙。终年58岁。
邱有岩有4子，均成器。长子应眉，万历四年入府学；次子应宾，万历丙子举人；三子应知，万历戊戌进士，任浙江副使；四子应翀，官至弥勒州同知。
